CRIBLAGE MOLÉCULAIRE A HAUT DEBIT
Description générale
Le criblage à haut débit permet d’explorer plusieurs centaines de milliers de molécules sur des cellules différenciées d’une lignée iPSC pathologique ayant un phénotype robuste et fiable et d’observer la correction de ce phénotype par des molécules testées.
Grâce aux iPSC et leurs dérivés :
- L’obtention d’une quantité illimitée de matériel biologique est réalisable pour un criblage à haut débit.
- Le criblage sur des cellules souches primitives ou cellules d’intérêt pertinentes d’une maladie est réalisable.
- Le criblage moléculaire contre des cibles génomiques connues spécifiques de la pathologie corrélée à l’histoire clinique et réponse thérapeutique du patient est réalisable.
INGESTEM dispose de deux plateformes robotisées de criblage cellulaire à haut-débit de dernière génération (technologie Agilent), capables de réaliser des dizaines de milliers de tests cellulaires en plaques 96 et 384 puits.
Ces plateformes sont fonctionnelles et compatibles pour les cellules souches pluripotentes et cellules différenciées, avec toutes sortes de molécules à cribler (petites molécules organiques, acides nucléiques (ARNi, …) permettant :
- D’identifier des molécules capables de corriger le phénoytype cellulaire associé à une pathologie génétique.
- D’individualiser des molécules capables d’optimiser la spécification précoce, engagement ou maturation terminale des cellules souches pluripotentes animales ou humaines, vers un lignage d’intérêt.
Etapes clés de la collaboration ou prestation
- Mise au point, miniaturisation, optimisation du test cellulaire et analyse qualitative
- Amplification du type cellulaire d’intérêt pour le criblage
- Design et réalisation du criblage fonctionnel à haut-débit (HTS, HCS)
- Traitement des données et analyses statistiques des résultats
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Livrables
- Gestion de projet collaboratif en amont pour optimiser le test cellulaire
- Analyse quantitative et qualitative des résultats
- Fourniture des hits molécules et gènes
Deux sites
- I-STEM, Evry (Amplification automatisée des cellules d’intérêt, modèles fonctionnels pour les maladies rares, criblage médicaments)
- IGBMC, Strasbourg (Modèles fonctionnels de pathologies diverses, criblage chimiothèque et CrisCas9 pan-génome)